病理实验被称之为“医之本”，但长期以来因为种种原因，病理实验工作者的都在一个相当恶劣的工作环境中工作。病理实验过程中的甲基苯(methylbenzene)（化学式：C6H6） 、二甲苯（dimethylbenzene）、福尔马林、脱水试剂、染色试剂以及包埋石蜡等各种有毒、有刺激性气味充实于整个实验流程中。其中苯类有机挥发物如果长期吸入过量可能导致人体内白细胞数量的锐减，从而导致白血病。 
    要解决这些问题，就必须对病理实验室进行科学的规划(设计大工程或作计划)和建设。如：将诊断办公区与实验区分成两个区域，诊断办公区宜靠南面，实验区宜靠北面。为标本保存、取材、脱水、包埋、染色等可能产生有毒、有刺激性气味的实验过程，采用通风设备加以保护，降低实验室有毒有害气体的含量。同时病理实验室是一个有序的流程，合理的安排不同的功能不仅有利于实验室的管理(guǎn lǐ)，也有利于工作效率的提高。

为保证检测工作的安全，生物安全实验室应符合BSL-2级实验室的要求，在生物安全实验室的出口处应设有非手动洗手装置和紧急洗眼装置，部分高污染风险(risk)的工作应在二级生物安全柜内进行。  
（1）HIV初筛实验室：分为清洁区、半污染区、污染区，面积不宜小于45㎡。  
（2）PCR实验室：分为试剂准备(ready)室、样品制备室、扩增分析室，各实验室前要有缓冲间，PCR总面积不宜小于60㎡。  
（3）微生物实验室：分为准备室、缓冲间和工作区，面积不宜小于35㎡。  

（4）采血区应单独成一区，采血窗口的长度不宜小于1.2m，宽度45-1500px为宜，采血窗口的数量应参考日平均门诊数量确定，并适当考虑将来发展需要。PCR实验室国家实验室代表国家最高水平，是按国际一流标准建立的，规模非常大，基本包括本学科领域所有研究方向，而且人员配备上要求面向国内外招聘最优秀的研究人员，直接参与国际竞争，往往是多学科交叉的创新平台。动物（SPF级）实验室实验脊椎动物生物安全防护实验室，其适用微生物范围与同级的一般生物安全防护实验室相同。（5）生化区在设计时应重点关注生化机，生化机的更新换代速度很快，在设计前应与设备厂家联系，确定设备的摆放位置、规格、重量、功率、用水量等参数。
实验（experiment)室建设前应根据微生物和生物医学实验室生物安全通用准则、GB19489-2008实验室生物安全通用要求、病原微生物实验室生物安全管理条例（国务院424号令）进行生物安全评估，确定实验室是否需要净化以及净化等级〔2-4〕。
评估结果：自动化实验室防护水平应不低于BSL-2级实验室要求，实际设计中实验室各项指标（target aim)完全符合BSL-2实验室要求，包括明确标识、独立更衣室、独立库房，配备了洗眼器、高压蒸汽灭菌器及应急工具。生物实验室结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于主要通过呼吸途径使人传染上严重的甚至是致死疾病的致病微生物及其毒素，通常已有预防传染的疫苗。此外还在设计中参考了BSL-3实验室建设的部分要求[5]。楼层高度不小于2.6m，实验室内通道净宽不小于1.5m，门宽度不小于1m，同时门的高度与宽度应方便实验室内仪器运输，建成后实验室门禁系统、换气频率(frequency)、温湿度控制等部分指标达到了BSL-3级实验室水平。