疾控中心实验室建设要符合国家现行的有关生物安全标准。  
疾控中心实验室的空气具有洁净度的要求，洁净等级按病原性微生物实验和感染程度确定，其地理位置应选择(xuanze)远离人烟稠密、交通繁忙和空气、水源、噪声严重污染地区。实验室家具即进行试验的场所。实验室是科学的摇篮，是科学研究的基地，科技发展的源泉，对科技发展起着非常重要的作用。疾控中心实验室要按照功能用途划区布置，将实验室与各区严格分开，人流、物流路径分明，有污染排放的区域要设在实验室的下风向，吸风口设在上风向，实验室周围不宜种植飞扬花粉、绒毛和落叶的植物。  
疾控中心实验室不同于其他医疗工程。其区别在于，不仅要求防止环境因素对实验室的污染和实验之间的交叉污染，同时还要防止实验过程中所使用的生物危害和潜在生物危害不致向周围环境释放造成污染。
疾控中心实验室设计建设原则：
节能降耗
对于温场均匀、波动度小、控温要求高的实验室，为降低实验室耗能，宜将温度（temperature)要求相同或接近的实验室布置在同一楼层邻近房间，由恒温恒湿控制系统的同一机组控制。实验室设计实验脊椎动物生物安全防护实验室，其适用微生物范围与同级的一般生物安全防护实验室相同。此外，加厚外墙、采用双层密封玻璃材质、安装闭门器等均有助于实验室恒温而达到节能的效果。
安全环保
对于危险性的(如石油、有机、高压)以及防爆实验室的门应向外开。实验室通风结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于对健康成年人已知无致病作用的微生物，如用于教学的普通微生物实验室等。只要允许，门上可设一玻璃观察窗，以便值班人员进行安全观察。易燃、易爆、强氧化（oxidation)物和还原剂类药品应保存在通风、阴凉、干燥、远离热(火)源的地方；化学试剂分类存放；有毒有害物品则专柜存放。对实验中发生有毒有害气体的操作控制，则必须在通风橱内进行，为此设计时应考虑通风橱的位置（position )。使用各种高压储气瓶时，应使用铁环等固定器材将其稳固在支架或墙壁上，防止因触碰而翻到。
留有余地
考虑到今后实验（experiment)室拓展检测/校准项目的需要，实验室的供电容量应留有余地；除常用的220V供电电源以外，还应考虑380V的电源供电；由于灯的效率(efficiency)和房间墙面反射率不断衰减，设计照度应大于标准照度等。
操作方便
例如有的设备是常年运转的(如烘箱、恒温箱、冰箱等)，为此，应提供专用电源，有的设备是实验过程中使用，当实验结束时机器即停止使用，对这些设备实验室可设置总开关，确保实验人员离开时统一切断电源。为利于操作控制，实验台宽度一般为0.75m，按两人能在两边坐着或者站着做实验，中间可走动一个人计算，两排实验台之间的净距宜为1.5m～1.8m。